Costa, une étape dans chaque jambe

Hesjedal seul en tête
Lars Bak et Jon Izaguirre sortent du peloton dès le premier kilomètre, et emmènent derrière eux un groupe imposant dont l'effectif atteint 44 coureurs à son maximum. A l'avant, Izaguirre change de partenaire et rentre dans la montée vers le col du Glandon en compagnie de Ryder Hesjedal. Au sommet, le duo bascule avec 3'10'' d'avance sur le groupe, d'où sont sortis les candidats au maillot à pois que sont Rolland et Riblon. Accompagnés de Moser, et ensuite de Cunego, puis de Flecha, les contre attaquants se rapprochent à moins de deux minutes, mais avancent sous la menace d'un mini-peloton. Ils sont d'ailleurs repris en abordant la montée vers le col de la Madeleine, hormis Pierre Rolland, qui se lance seul à la poursuite de Ryder Hesjedal, lui-même débarrassé de Jon Izaguirre dès les premières pentes. Le coureur d'Europcar rejoint le Canadien à 4,5 km du sommet, puis saisit les 25 points attribués au premier.

Rolland en tête au col de la Madeleine
Derrière les deux hommes de tête, le groupe de poursuite a connu une sélection favorable à une association de 27 coureurs : De Marchi (CAN), De Clercq (LTB), Burghardt, Moinard (BMC), Bakelants, Didier, Klöden (RLT), Geniez (FDJ), Bardet (ALM), Hernandez (TST), J.Izaguirre, Nieve, Perez, Sicard (EUS), Costa, Plaza, Rojas (MOV), Coppel, Navarro (COF), Cunego (LAM), Gesink, Nordhaug (BEL), Dumoulin, Geschke (ARG), Flecha, Hoogerland (VCD) et Feillu (SOJ) atteignent le col de la Madeleine avec 4' de retard. Le peloton, peu préoccupé par le destin de l'échappée, s'y présente avec 12' de retard.

Costa en solo
Hesjedal et Rolland roulent encore ensemble au sprint intermédiaire d'Albertville (3' d'avance sur leurs premiers poursuivants), mais le Canadien lâche prise en montant vers le col de Tamié. Le coureur d'Europcar y poursuit sa récolte de points, mais ses rivaux pour l'étape se rapprochent alors à 1'50''. Dans la montée au col de l'Epine, il préserve et soigne même son avantage, avec 2' à la bascule. Mais le rapprochement essentiellement mené par Coppel et Navarro en se dirigeant vers la dernière ascension compromet nettement la situation. Dans la montée au col de la Croix-Fry, les accélération de Navarro, et surtout de Costa à 11 km du sommet, condamnent Pierre Rolland, déposé  à 20 km de l'arrivée.

Accélération de Valverde
En solitaire, Rui Costa termine l'ascension en contrôlant le petit groupe qui se défend le mieux, avec Klöden, Bakelants, Navarro et De Clercq. Dans la plongée sur le Grand-Bornand, le Portugais n'a plus qu'Andreas Klöden comme premier poursuivant, mais dispose d'une minute de marge pour aller cueillir sa deuxième victoire d'étape sur le 100ème Tour de France. Au sein du groupe Maillot Jaune, les accélérations de Valverde et de Gadret n'ont pas réellement perturbé les plans de l'équipe Sky. La pression mise par les Saxo-Tinkoff n'est pas suivie d'effet non plus, si ce n'est que le groupe ne comprend plus que 10 coureurs au moment de franchir la ligne d'arrivée. Le sommet de la hiérarchie reste inchangé.